《新世纪科学史系列》是自然科学史研究所和辽宁教育出版社共同策划出版，在2000-2003年之间陆续推出科学史学科8种优秀研究成果，依次为：

　　1. 祖冲之科学著作校释（严敦杰著）

　　2. 明清测天仪器之欧化（张柏春著）

　　3. 科学之旅（路甬祥等著）

　　4. 何丙郁中国科技史论集（何丙郁著）

　　5. 阿输吠陀印度的传统医学（廖育群著）

　　6. 数学？历史？社会（杜石然著）

　　7. 数学典籍索引秦汉至宋社会经济史料（郭正忠，[法]蓝克著）

　　8. 墨经数理（梅荣照著）

　　该《系列》包括科学史、技术史、医学史及其相关领域内有创意的专题研究，由时任自然科学史所所长刘钝和时任辽宁教育出版社社长俞晓群联合为该《系列》作序。其中，《科学之旅》由时任中国科学院院长路甬祥院士领导专家团队完成，于2002年荣获第十三届中国图书奖。

　　该《系列》的出版促进了科学技术史领域的学术研究，推动了科学史学科在中国的再建制化发展。