根据中国科学院研究生院《关于表彰2012—2013学年第二批优秀学生的决定》，自然科学史研究所2012-2013学年优秀学生获奖名单为：

　  三好学生标兵（1人）

　　    杜新豪     201218002917007           

　  三好学生（11人）　　 

　　    吕传益     201118002917002  徐丁丁     201118002917008

　　    夏钊         201128002901007  杨帆         201128002917003

　　    杨丽娟     201128002917004  卢方方     201128002917008

　　    陈桂权     201218002917006  付雷         201218002917008

　　    陈沐         201118002917007           

　　    石爱洁     201228002917005  杨小华  201228002917007

　　优秀学生干部（2人）

　　   薛中营     201128002917009           

　　   张炳君     201228002917008

　　优秀毕业生（1人）

　　   余佳         201028002917005